中国冶金地质总局目前下属12个局院（所、中心）、6个控股公司，68个三级企事业单位。

12个局院（所、中心）是：
　　中国冶金地质总局一局（河北省三河市）
　　中国冶金地质总局二局（福建省福州市）
　　中国冶金地质总局三局（山西省太原市）
　　中国冶金地质总局山东局（山东省济南市）
　　中国冶金地质总局中南局（湖北省武汉市）
　　中国冶金地质总局西北局（陕西省西安市）
　　中国冶金地质总局矿产资源研究院（北京市）
　　中国冶金地质总局地球物理勘查院（河北省保定市）
　　中国冶金地质总局昆明地质勘查院（云南省昆明市）
　　中国冶金地质总局管理干部学院（山东省济南市）
　　中国冶金地质总局广州地质调查所（广东省广州市）
　　中国冶金地质总局矿产资源信息中心（北京市）

6个控股公司是：
　　中基发展建设工程有限责任公司（北京市）
　　黑旋风锯业股份有限公司（湖北省宜昌市）
　　黑旋风工程机械开发有限公司（湖北省宜昌市）
　　晶日金刚石工业有限公司（河北省三河市）
　　正元国际矿业有限公司（北京市）
    正元置业有限公司（北京市）

中国冶金地质总局机关设办公室（党办）、人力资源部（党委组织部）、资产财务部、战略发展部、地质勘查部、审计部、国际合作部（外事办）、法律事务部（上市办）、纪检监察部、党群工作部、机关服务中心（离退办）等部门。